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MeV 軟件做熱圖 | 科研黑眼圈克星!
發(fā)布時間:2020-04-24 瀏覽次數(shù):17454
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剛開學(xué),是否就被老板叫去


隨之而來就是漸漸加深的黑眼圈


小編這里有一個方子

就連黑眼圈都木有了

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熱圖小工具直 -MEV(Multiple Experiment Viewer)


01、 軟件安裝

Mev 軟件官網(wǎng)下載 https://sourceforge.net/projects/mev-tm4/files/mev-tm4/,無需安裝,解壓后,雙擊 TMEV.exe 即可,但是需要在使用該軟件之前安裝 JAVA。

02、 軟件使用

準(zhǔn)備數(shù)據(jù)

如下圖,首列是 gene symbol,geneID 或者 probe,后邊是每個樣本的信號值 / 測序 FPKM 值。


打開軟件

選擇 file——load data——browse——選擇數(shù)據(jù)打開——Load 數(shù)據(jù)

對樣本按行進(jìn)行歸一化

adjust data---Gene/Row Adjustments---Normalize Gene/Rows



聚類

選擇 HCL(層次聚類)





聚類完結(jié)果,點左側(cè) HCL1,點 HCL tree




參數(shù)調(diào)整

調(diào)整 1——顏色





調(diào)整完



調(diào)整 2

在界面右擊,選擇紅色方框的選項,設(shè)置去掉紅色圈中標(biāo)志



調(diào)整 3

設(shè)置圖形大小

設(shè)置每個條形的寬高



03、 導(dǎo)出圖片

選擇 tiff 格式,對圖片命名,保存




得到的熱圖



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