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伯豪生物
21 天拿單細(xì)胞 RNA 測(cè)序原始數(shù)據(jù)!
發(fā)布時(shí)間:2020-04-17 瀏覽次數(shù):10033
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為什么要選擇伯豪生物?

1、伯豪生物豐富的懸液制備經(jīng)驗(yàn)

伯豪生物單細(xì)胞團(tuán)隊(duì) 2019 年自主消化了包括人、鼠、豬、雞、魚、羊、牛、水稻、楊樹、番茄(植物樣品抽提細(xì)胞核)等在內(nèi)的近千例樣品,平均上機(jī)率超過 60%(業(yè)內(nèi)平均上機(jī)率為 35%-50%)。并在 2020 年 1 月制備懸液 100 余例,上機(jī)率達(dá)到 90%。消化過程均全部人工操作,積累了非常的單細(xì)胞懸液制備經(jīng)驗(yàn)。

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2、較高的數(shù)據(jù)可重現(xiàn)性

單細(xì)胞團(tuán)隊(duì)在自主消化并獲得原始數(shù)據(jù)后的分析結(jié)果顯示:肝臟、胃、皮膚、肺、視網(wǎng)膜、脂肪、腦、息肉、肌腱、血管、胚胎、心臟瓣膜、耳蝸、膽管、睪丸、子宮內(nèi)膜等的分群數(shù)據(jù)和測(cè)得的基因數(shù)目可以比較好的重現(xiàn)組織內(nèi)部的細(xì)胞亞群特征,數(shù)據(jù)的可重復(fù)性比較高。成功協(xié)助部分實(shí)驗(yàn)室避免了研究人員由于學(xué)業(yè)的更替導(dǎo)致前后數(shù)據(jù)產(chǎn)出的不穩(wěn)定。


視網(wǎng)膜分群數(shù)據(jù)(C0 亞群仍可繼續(xù)細(xì)分亞群)


注: 從細(xì)胞注釋的結(jié)果里可以看出,這批數(shù)據(jù)主要的細(xì)胞類型包括 9 大類,其中 T 細(xì)胞、NK 細(xì)胞和巨噬細(xì)胞占大部分。同時(shí)巨噬細(xì)分還分成了單核來源的巨噬細(xì)胞(MDSC-like cells)和肝臟固有的巨噬細(xì)胞(TAM-like cells)。


3、定制化的分析策略

單細(xì)胞團(tuán)隊(duì)在后期數(shù)據(jù)分析方面,整理了多套個(gè)性化分析思路(腫瘤類的單細(xì)胞分析已經(jīng)聯(lián)合 TCGA 數(shù)據(jù)庫做更多高級(jí)個(gè)性化分析),目前正在為幾十個(gè)科研團(tuán)隊(duì)提供定制化的單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析服務(wù)。


整體亞群 GSEA 功能分析



細(xì)胞間通訊分析



腫瘤細(xì)胞的良性惡性區(qū)分:Case 組(癌)包含較多腫瘤細(xì)胞,Control(癌旁)沒有檢測(cè)到腫瘤細(xì)胞



Marker 基因的上游轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子分析:

轉(zhuǎn)錄因子 SPI1(PU.1)激活了該亞群 marker 基因的表達(dá),并且 SPI1 本身也是這個(gè)亞群的 marker 基因

活動(dòng)解釋權(quán):

本活動(dòng)的解釋權(quán)歸屬于   上海伯豪生物技術(shù)有限公司。


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